MAN 1 Kota Pekalongan sebagai pelopor Sekolah Ramah Anak, dalam usaha mewujudkan Sekolah Ramah Anak perlu didukung berbagai pihak antara lain keluarga, masyarakat dan lingkungan. MAN 1 Kota Pekalongan telah meluncurkan berbagai program bimbingan konseling dan perlindungan anak secara offline dan online.